Pepin käyttöliittymä koostuu työpöydistä, jotka toteutetaan eri käyttäjäryhmien roolien mukaan. Jokaisen työpöydän peruskäyttöoikeudet määräytyvät organisaation käyttäjäroolien mukaisesti. Oikeuksia voi tarkentaa ja lisätä käyttöoikeushallinnassa.